Το σύστημα in situ υβριδικής ανάλυσης φθορισμού MFISH είναι ένα νέο πρακτικό λογισμικό εικόνας που έχει αναπτυχθεί ειδικά για την συλλογή και επεξεργασία φθορισμένων μικροεικόνων. Αυτό το σύστημα ανάλυσης υβριδισμού in situ χρησιμοποιεί ένα ειδικό ανιχνευτή ισονουκλενικού οξέος που έχει σηματοδοτηθεί με φθορά και υβραδίζεται με τα αντίστοιχα μόρια DNA στόχου ή μόρια RNA εντός του κυττάρου, προσδιορίζοντας τη μορφολογία και την κατανομή των χρωματισμένων κυττάρων ή κυτταρικών οργάνων μετά την υβράδιση με ένα ειδικό ανιχνευτή, παρακολουθώντας το φθοραστικό σήμα σε μικροσκόπιο ή σε σαρωτή λέιζερ συγκέντρωσης, ή εντοπίζοντας περιοχές DNA ή μόρια RNA που συνδέονται με το φθ